Od školního roku 2006/2007 byl zaveden do výuky Školní vzdělávací program „Chléb a hry“ (dále jen ŠVP) pro nižší stupeň gymnázia, od září 2009 je ŠVP závazný i pro vyšší stupeň gymnázia. Kompletní znění ŠVP je k dispozici v sekci Dokumenty.
Ústředním pojmem probíhající reformy ve školství a relativně novým principem, který formuluje vrcholný cíl působení školy, jsou klíčové kompetence. Smyslem a cílem vzdělávání na nižším a vyšším stupni gymnázia je vybavit všechny žáky souborem takových kompetencí na úrovni, která je pro ně dosažitelná, a připravit je tak na další vzdělávání a uplatnění ve společnosti. Za klíčové jsou považovány kompetence k učení, řešení problémů, kompetence komunikativní, sociální a personální, kompetence občanská a kompetence k podnikavosti (více ve ŠVP Chléb a hry).
Od primy se žáci učí dvěma cizím jazykům – angličtině a němčině. Ve vyšších ročnících vede většinu hodin anglické konverzace lektor – rodilý mluvčí. Dalším volitelným jazykem je latina v septimě. Ve výuce je věnována velká pozornost aktuálním tématům, dále rozvíjení kompetencí žáků a také informačním technologiím.
V rámci výuky podle ŠVP jsou zavedeny předměty na nižším stupni gymnázia: mediální výchova, výchova demokratického občana, člověk a svět práce a výchova ke zdraví.
Ve vyšších ročnících gymnázia jsou zařazeny tyto volitelné předměty:
- kvinta: konverzace v cizím jazyce, seminář z fyziky, seminář z dějepisu, seminář tvůrčího psaní
- sexta: seminář z anglického jazyka I (příprava na certifikát B2), konverzace v německém jazyce, seminář z matematiky, environmentální seminář, seminář z chemie
- septima: seminář z anglického jazyka II (příprava na certifikát C1), seminář z německého jazyka (příprava na certifikát B1), latinský jazyk, rétorika, seminář z matematiky, seminář z fyziky, seminář z informatiky, seminář z literatury a filmu, biologicko-chemický seminář, dějepisný a společenskovědní seminář
- oktáva: konverzace v cizím jazyce, seminář z informatiky, seminář z matematiky, seminář z fyziky, seminář z biologie, seminář z chemie, seminář z dějepisu, seminář ze zeměpisu, seminář ze základů společenských věd.
Při škole působí Školní klub, ve kterém žáci mohou volit z pestré nabídky zájmových oddělení, od uměleckých, technických, sportovních po humanitní, včetně cizích jazyků (španělštiny a francouzštiny).
Gymnázium, Praha 9, Chodovická 2250 je školou, ve které mohou probíhat odborné praxe studentů učitelství. Z tohoto důvodu se řádné výuky s vědomím vedení školy průběžně mohou účastnit studenti oboru učitelství (náslechy, výukové hodiny).